Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUP58Q9BVL2 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms