Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms