Protein–RNA interactions for Protein: Q99496

RNF2, E3 ubiquitin-protein ligase RING2, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF2Q99496 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RNF2Q99496 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF2Q99496 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF2Q99496 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF2Q99496 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF2Q99496 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF2Q99496 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF2Q99496 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF2Q99496 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RNF2Q99496 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF2Q99496 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF2Q99496 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF2Q99496 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF2Q99496 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF2Q99496 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF2Q99496 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF2Q99496 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF2Q99496 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF2Q99496 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF2Q99496 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF2Q99496 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF2Q99496 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF2Q99496 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF2Q99496 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF2Q99496 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF2Q99496 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF2Q99496 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF2Q99496 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF2Q99496 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF2Q99496 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF2Q99496 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF2Q99496 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF2Q99496 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF2Q99496 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF2Q99496 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF2Q99496 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF2Q99496 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF2Q99496 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF2Q99496 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF2Q99496 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF2Q99496 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF2Q99496 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RNF2Q99496 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RNF2Q99496 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RNF2Q99496 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RNF2Q99496 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RNF2Q99496 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RNF2Q99496 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RNF2Q99496 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RNF2Q99496 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RNF2Q99496 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RNF2Q99496 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
RNF2Q99496 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF2Q99496 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF2Q99496 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF2Q99496 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF2Q99496 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF2Q99496 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF2Q99496 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RNF2Q99496 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF2Q99496 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF2Q99496 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF2Q99496 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF2Q99496 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF2Q99496 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF2Q99496 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF2Q99496 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF2Q99496 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF2Q99496 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF2Q99496 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF2Q99496 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF2Q99496 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF2Q99496 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF2Q99496 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF2Q99496 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF2Q99496 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF2Q99496 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF2Q99496 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF2Q99496 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF2Q99496 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF2Q99496 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF2Q99496 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF2Q99496 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF2Q99496 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF2Q99496 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF2Q99496 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF2Q99496 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF2Q99496 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF2Q99496 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF2Q99496 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF2Q99496 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF2Q99496 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RNF2Q99496 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RNF2Q99496 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF2Q99496 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF2Q99496 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF2Q99496 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF2Q99496 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF2Q99496 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF2Q99496 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms