Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF0

Putative uncharacterized protein LOC100506887, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q96MF0 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q96MF0 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Q96MF0 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q96MF0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q96MF0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q96MF0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q96MF0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q96MF0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q96MF0 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q96MF0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q96MF0 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q96MF0 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q96MF0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q96MF0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q96MF0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q96MF0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q96MF0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q96MF0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q96MF0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q96MF0 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q96MF0 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q96MF0 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Q96MF0 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q96MF0 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q96MF0 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q96MF0 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q96MF0 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q96MF0 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q96MF0 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q96MF0 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Q96MF0 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Q96MF0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q96MF0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q96MF0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q96MF0 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q96MF0 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Q96MF0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q96MF0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q96MF0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q96MF0 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q96MF0 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q96MF0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q96MF0 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q96MF0 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Q96MF0 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q96MF0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q96MF0 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q96MF0 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Q96MF0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q96MF0 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q96MF0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q96MF0 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q96MF0 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q96MF0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q96MF0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q96MF0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q96MF0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q96MF0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q96MF0 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Q96MF0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q96MF0 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q96MF0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q96MF0 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q96MF0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q96MF0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q96MF0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q96MF0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q96MF0 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q96MF0 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q96MF0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q96MF0 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q96MF0 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q96MF0 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q96MF0 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q96MF0 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q96MF0 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q96MF0 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q96MF0 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q96MF0 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q96MF0 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Q96MF0 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q96MF0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q96MF0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q96MF0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q96MF0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q96MF0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Q96MF0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q96MF0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q96MF0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q96MF0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q96MF0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q96MF0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q96MF0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q96MF0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q96MF0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q96MF0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q96MF0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q96MF0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q96MF0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q96MF0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms