Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPS50Q96JG6 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms