Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC9

EAF1, ELL-associated factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF1Q96JC9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms