Protein–RNA interactions for Protein: Q96HU1

SGSM3, Small G protein signaling modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM3Q96HU1 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGSM3Q96HU1 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms