Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM3DQ96BQ1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
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