Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 RNF220-207ENST00000470498 594 ntTSL 34.57□□□□□ -1.683e-10■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.693e-10■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 LINC01091-202ENST00000511919 590 ntTSL 34.4□□□□□ -1.716e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.766e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 UBE2W-205ENST00000519277 747 ntTSL 33.95□□□□□ -1.783e-10■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 MVB12B-203ENST00000470567 421 ntTSL 53.85□□□□□ -1.793e-10■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.823e-10■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 ARHGAP5-211ENST00000557643 872 ntTSL 33.53□□□□□ -1.846e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 PAXBP1-207ENST00000466846 3879 ntTSL 23.35□□□□□ -1.873e-10■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 PAXBP1-205ENST00000445049 473 ntTSL 33.27□□□□□ -1.893e-10■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 SMYD3-205ENST00000453676 562 ntTSL 42.99□□□□□ -1.933e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 MYO18A-222ENST00000590565 261 ntTSL 32.81□□□□□ -1.966e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 ARHGAP5-207ENST00000554090 543 ntTSL 52.66□□□□□ -1.986e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 UBE2J2-213ENST00000471154 336 ntTSL 52.62□□□□□ -1.993e-10■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -23e-10■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 NAA25-202ENST00000547133 421 ntTSL 52.54□□□□□ -26e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.016e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 FAM204A-210ENST00000491416 576 ntTSL 21.96□□□□□ -2.16e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 FREM1-208ENST00000486223 815 ntTSL 31.95□□□□□ -2.16e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 NEDD4L-212ENST00000585594 220 ntTSL 1 (best)1.65□□□□□ -2.156e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 UBE2W-202ENST00000422906 3903 ntTSL 1 (best)1.48□□□□□ -2.173e-10■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 ZMYND8-209ENST00000441977 175 ntTSL 30.22□□□□□ -2.374e-7■■■■■ 47.1
TBRG4Q969Z0 MAD1L1-215ENST00000464742 449 ntTSL 515.95■□□□□ 0.143e-6■■■■■ 47
TBRG4Q969Z0 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.174e-7■■■■■ 47
TBRG4Q969Z0 C2orf48-202ENST00000619640 480 ntTSL 1 (best)15.15■□□□□ 0.024e-7■■■■■ 47
TBRG4Q969Z0 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.171e-6■■■■■ 46.9
TBRG4Q969Z0 FAF1-201ENST00000371778 1643 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.861e-6■■■■■ 46.9
TBRG4Q969Z0 PRKCA-202ENST00000413366 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.094e-7■■■■■ 46.8
TBRG4Q969Z0 PRKCA-201ENST00000284384 2718 ntTSL 57.77□□□□□ -1.174e-7■■■■■ 46.8
TBRG4Q969Z0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.283e-6■■■■■ 46.7
TBRG4Q969Z0 ANKRD28-202ENST00000412318 4408 ntTSL 24.62□□□□□ -1.673e-6■■■■■ 46.7
TBRG4Q969Z0 LRBA-211ENST00000513021 568 ntTSL 49.02□□□□□ -0.976e-7■■■■■ 46.6
TBRG4Q969Z0 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.183e-6■■■■■ 46.5
TBRG4Q969Z0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.281e-8■■■■■ 46.4
TBRG4Q969Z0 TFDP2-201ENST00000464782 640 ntTSL 421.08■□□□□ 0.972e-6■■■■■ 46.4
TBRG4Q969Z0 AFF1-206ENST00000507468 1486 ntTSL 1 (best)20.77■□□□□ 0.922e-6■■■■■ 46.4
TBRG4Q969Z0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.751e-8■■■■■ 46.4
TBRG4Q969Z0 TFDP2-207ENST00000475734 578 ntTSL 519.68■□□□□ 0.742e-6■■■■■ 46.4
TBRG4Q969Z0 TFDP2-208ENST00000476617 596 ntTSL 419.19■□□□□ 0.662e-6■■■■■ 46.4
TBRG4Q969Z0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.642e-6■■■■■ 46.4
TBRG4Q969Z0 TFDP2-221ENST00000495095 575 ntTSL 417.62■□□□□ 0.412e-6■■■■■ 46.4
TBRG4Q969Z0 TFDP2-219ENST00000494358 578 ntTSL 1 (best)17.41■□□□□ 0.382e-6■■■■■ 46.4
TBRG4Q969Z0 AFF1-204ENST00000503477 1478 ntTSL 216.73■□□□□ 0.272e-6■■■■■ 46.4
TBRG4Q969Z0 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.221e-8■■■■■ 46.4
TBRG4Q969Z0 AFF1-205ENST00000504956 1668 ntTSL 215.67■□□□□ 0.12e-6■■■■■ 46.4
TBRG4Q969Z0 TFDP2-215ENST00000489671 9857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.332e-6■■■■■ 46.4
TBRG4Q969Z0 TFDP2-203ENST00000467634 571 ntTSL 412.7□□□□□ -0.382e-6■■■■■ 46.4
TBRG4Q969Z0 ATP6V0E2-208ENST00000483478 475 ntTSL 312.67□□□□□ -0.381e-6■■■■■ 46.4
TBRG4Q969Z0 AFF1-202ENST00000395146 9285 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.572e-6■■■■■ 46.4
TBRG4Q969Z0 TFDP2-213ENST00000487734 1469 ntTSL 57.95□□□□□ -1.142e-6■■■■■ 46.4
TBRG4Q969Z0 DIP2B-201ENST00000301180 8593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.152e-6■■■■■ 46.4
TBRG4Q969Z0 TFDP2-214ENST00000488107 416 ntTSL 53.73□□□□□ -1.812e-6■■■■■ 46.4
TBRG4Q969Z0 AFF1-207ENST00000511442 463 ntTSL 31.39□□□□□ -2.192e-6■■■■■ 46.4
TBRG4Q969Z0 HSPG2-203ENST00000374695 14327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.957e-7■■■■■ 46.4
TBRG4Q969Z0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.377e-9■■■■■ 46.2
TBRG4Q969Z0 TOM1-205ENST00000424387 2211 ntTSL 517.9■□□□□ 0.461e-6■■■■■ 46.2
TBRG4Q969Z0 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.422e-6■■■■■ 46.2
TBRG4Q969Z0 HNRNPL-212ENST00000601449 1918 ntTSL 517.09■□□□□ 0.337e-9■■■■■ 46.2
TBRG4Q969Z0 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.32e-6■■■■■ 46.2
TBRG4Q969Z0 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.291e-6■■■■■ 46.2
TBRG4Q969Z0 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.281e-6■■■■■ 46.2
TBRG4Q969Z0 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.121e-6■■■■■ 46.2
TBRG4Q969Z0 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.091e-6■■■■■ 46.2
TBRG4Q969Z0 TOM1-203ENST00000404284 2622 ntTSL 215.59■□□□□ 0.091e-6■■■■■ 46.2
TBRG4Q969Z0 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.081e-6■■■■■ 46.2
TBRG4Q969Z0 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.022e-6■■■■■ 46.2
TBRG4Q969Z0 HNRNPL-210ENST00000600873 1633 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.257e-9■■■■■ 46.2
TBRG4Q969Z0 USP24-201ENST00000294383 10549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.31e-6■■■■■ 46.2
TBRG4Q969Z0 HNRNPL-202ENST00000388749 1952 ntTSL 510.7□□□□□ -0.77e-9■■■■■ 46.2
TBRG4Q969Z0 MBNL1-209ENST00000460591 898 ntTSL 38.8□□□□□ -12e-6■■■■■ 46.2
TBRG4Q969Z0 MBNL1-212ENST00000464596 989 ntTSL 58.47□□□□□ -1.052e-6■■■■■ 46.2
TBRG4Q969Z0 MBNL1-213ENST00000465907 945 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.262e-6■■■■■ 46.2
TBRG4Q969Z0 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.292e-6■■■■■ 46.2
TBRG4Q969Z0 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.392e-6■■■■■ 46.2
TBRG4Q969Z0 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.392e-6■■■■■ 46.2
TBRG4Q969Z0 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.462e-6■■■■■ 46.2
TBRG4Q969Z0 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.712e-6■■■■■ 46.2
TBRG4Q969Z0 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.752e-6■■■■■ 46.2
TBRG4Q969Z0 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.812e-6■■■■■ 46.2
TBRG4Q969Z0 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.812e-6■■■■■ 46.2
TBRG4Q969Z0 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.812e-6■■■■■ 46.2
TBRG4Q969Z0 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.832e-6■■■■■ 46.2
TBRG4Q969Z0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.193e-8■■■■■ 46.2
TBRG4Q969Z0 ATP9A-201ENST00000311637 7437 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.683e-8■■■■■ 46.2
TBRG4Q969Z0 TBC1D14-201ENST00000409757 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.468e-7■■■■■ 46.1
TBRG4Q969Z0 TBC1D14-207ENST00000448507 4887 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.78e-7■■■■■ 46.1
TBRG4Q969Z0 TBC1D14-202ENST00000410031 4201 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.778e-7■■■■■ 46.1
TBRG4Q969Z0 MYO19-204ENST00000610992 5743 ntTSL 214.63□□□□□ -0.079e-7■■■■■ 46.1
TBRG4Q969Z0 MYO19-203ENST00000610930 3271 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.379e-7■■■■■ 46.1
TBRG4Q969Z0 MYO19-213ENST00000614623 4054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.459e-7■■■■■ 46.1
TBRG4Q969Z0 MYO19-226ENST00000621550 4299 ntTSL 511.49□□□□□ -0.579e-7■■■■■ 46.1
TBRG4Q969Z0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.793e-8■■■■■ 46.1
TBRG4Q969Z0 PXN-203ENST00000323871 5457 ntTSL 219.35■□□□□ 0.693e-6■■■■■ 46.1
TBRG4Q969Z0 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.612e-6■■■■■ 46.1
TBRG4Q969Z0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.453e-8■■■■■ 46.1
TBRG4Q969Z0 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.143e-6■■■■■ 46.1
TBRG4Q969Z0 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.113e-8■■■■■ 46.1
TBRG4Q969Z0 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.13e-6■■■■■ 46.1
TBRG4Q969Z0 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.131e-6■■■■■ 46.1
TBRG4Q969Z0 PXN-204ENST00000424649 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.443e-6■■■■■ 46.1
Retrieved 100 of 20,769 protein–RNA pairs in 105.7 ms