Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBXN4Q92575 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms