Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHG7

SVIP, Small VCP/p97-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVIPQ8NHG7 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SVIPQ8NHG7 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SVIPQ8NHG7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SVIPQ8NHG7 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SVIPQ8NHG7 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SVIPQ8NHG7 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 ODF2-213ENST00000448249 2059 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 SMAD1-215ENST00000515385 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 DENND1C-201ENST00000381480 2816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 DNAJB12-202ENST00000394903 3198 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 AC004834.1-202ENST00000638785 1737 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 ZNF148-206ENST00000485866 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 SLC33A1-201ENST00000359479 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 TBCCD1-205ENST00000446782 2186 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 PTGES3L-201ENST00000409446 1781 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 RUNX1T1-227ENST00000520724 2103 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.8 ms