Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HELBQ8NG08 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms