Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF548Q8NEK5 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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