Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms