Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZBED9Q6R2W3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZBED9Q6R2W3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
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