Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
WSCD1Q658N2 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
WSCD1Q658N2 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
WSCD1Q658N2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
WSCD1Q658N2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms