Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms