Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTXN3Q4LDR2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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