Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ECM1Q16610 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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ECM1Q16610 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
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ECM1Q16610 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
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ECM1Q16610 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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ECM1Q16610 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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ECM1Q16610 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ECM1Q16610 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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ECM1Q16610 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ECM1Q16610 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ECM1Q16610 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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ECM1Q16610 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ECM1Q16610 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ECM1Q16610 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ECM1Q16610 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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