Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms