Protein–RNA interactions for Protein: Q15406

NR6A1, Nuclear receptor subfamily 6 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR6A1Q15406 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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NR6A1Q15406 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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NR6A1Q15406 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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NR6A1Q15406 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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NR6A1Q15406 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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NR6A1Q15406 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NR6A1Q15406 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms