Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAM2Q15035 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms