Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EBI3Q14213 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EBI3Q14213 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EBI3Q14213 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EBI3Q14213 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EBI3Q14213 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EBI3Q14213 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EBI3Q14213 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EBI3Q14213 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EBI3Q14213 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EBI3Q14213 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EBI3Q14213 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EBI3Q14213 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EBI3Q14213 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EBI3Q14213 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EBI3Q14213 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EBI3Q14213 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EBI3Q14213 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EBI3Q14213 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EBI3Q14213 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EBI3Q14213 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EBI3Q14213 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EBI3Q14213 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EBI3Q14213 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EBI3Q14213 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EBI3Q14213 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EBI3Q14213 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EBI3Q14213 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EBI3Q14213 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EBI3Q14213 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EBI3Q14213 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EBI3Q14213 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EBI3Q14213 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EBI3Q14213 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EBI3Q14213 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EBI3Q14213 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EBI3Q14213 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EBI3Q14213 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EBI3Q14213 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EBI3Q14213 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EBI3Q14213 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EBI3Q14213 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EBI3Q14213 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EBI3Q14213 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EBI3Q14213 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EBI3Q14213 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EBI3Q14213 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EBI3Q14213 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EBI3Q14213 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EBI3Q14213 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EBI3Q14213 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EBI3Q14213 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EBI3Q14213 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EBI3Q14213 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EBI3Q14213 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
EBI3Q14213 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EBI3Q14213 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.02■□□□□ -0
EBI3Q14213 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EBI3Q14213 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.02■□□□□ -0
EBI3Q14213 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
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EBI3Q14213 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EBI3Q14213 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
EBI3Q14213 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EBI3Q14213 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
EBI3Q14213 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EBI3Q14213 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EBI3Q14213 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
EBI3Q14213 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EBI3Q14213 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EBI3Q14213 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EBI3Q14213 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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EBI3Q14213 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EBI3Q14213 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EBI3Q14213 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EBI3Q14213 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EBI3Q14213 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EBI3Q14213 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EBI3Q14213 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EBI3Q14213 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EBI3Q14213 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EBI3Q14213 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EBI3Q14213 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EBI3Q14213 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EBI3Q14213 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EBI3Q14213 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EBI3Q14213 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EBI3Q14213 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EBI3Q14213 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EBI3Q14213 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
EBI3Q14213 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EBI3Q14213 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EBI3Q14213 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EBI3Q14213 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EBI3Q14213 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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