Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms