Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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