Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms