Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
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