Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
KRR1Q13601 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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