Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPA4Q13156 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPA4Q13156 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.4 ms