Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.32e-11■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.192e-11■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 TBL1XR1-214ENST00000457928 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.725e-7■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.125e-7■■■■□ 20.1
TARDBPQ13148 NADK-206ENST00000464373 722 ntTSL 227.14■■□□□ 1.945e-6■■■■□ 20
TARDBPQ13148 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.795e-6■■■■□ 20
TARDBPQ13148 NADK-205ENST00000460602 974 ntTSL 225.08■■□□□ 1.615e-6■■■■□ 20
TARDBPQ13148 NADK-212ENST00000492768 859 ntTSL 325.08■■□□□ 1.615e-6■■■■□ 20
TARDBPQ13148 R3HDM1-215ENST00000483021 539 ntTSL 319.84■□□□□ 0.775e-6■■■■□ 20
TARDBPQ13148 NADK-213ENST00000492845 937 ntTSL 218.7■□□□□ 0.585e-6■■■■□ 20
TARDBPQ13148 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.525e-6■■■■□ 20
TARDBPQ13148 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.515e-6■■■■□ 20
TARDBPQ13148 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.425e-6■■■■□ 20
TARDBPQ13148 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.135e-6■■■■□ 20
TARDBPQ13148 CYSTM1-202ENST00000504227 588 ntTSL 513.17□□□□□ -0.35e-6■■■■□ 20
TARDBPQ13148 CYSTM1-204ENST00000509789 813 ntTSL 413.17□□□□□ -0.35e-6■■■■□ 20
TARDBPQ13148 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.315e-6■■■■□ 20
TARDBPQ13148 R3HDM1-213ENST00000463230 2241 ntTSL 212.89□□□□□ -0.355e-6■■■■□ 20
TARDBPQ13148 OSBPL3-208ENST00000409863 3490 ntTSL 1 (best)11.24□□□□□ -0.615e-6■■■■□ 20
TARDBPQ13148 NADK-204ENST00000378625 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.625e-6■■■■□ 20
TARDBPQ13148 CYSTM1-203ENST00000509589 665 ntTSL 310.7□□□□□ -0.75e-6■■■■□ 20
TARDBPQ13148 OSBPL3-207ENST00000409759 3219 ntTSL 510.67□□□□□ -0.75e-6■■■■□ 20
TARDBPQ13148 OSBPL3-204ENST00000409069 2614 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.885e-6■■■■□ 20
TARDBPQ13148 R3HDM1-208ENST00000438014 582 ntTSL 58.78□□□□□ -15e-6■■■■□ 20
TARDBPQ13148 OSBPL3-202ENST00000396429 2707 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.035e-6■■■■□ 20
TARDBPQ13148 OSBPL3-203ENST00000396431 2969 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.075e-6■■■■□ 20
TARDBPQ13148 OSBPL3-205ENST00000409452 3344 ntTSL 1 (best)8.22□□□□□ -1.095e-6■■■■□ 20
TARDBPQ13148 OSBPL3-206ENST00000409555 3088 ntTSL 58.11□□□□□ -1.115e-6■■■■□ 20
TARDBPQ13148 TMEM245-205ENST00000491854 2435 ntTSL 27.38□□□□□ -1.235e-6■■■■□ 20
TARDBPQ13148 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.485e-6■■■■□ 20
TARDBPQ13148 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.675e-6■■■■□ 20
TARDBPQ13148 R3HDM1-219ENST00000488035 502 ntTSL 33.74□□□□□ -1.815e-6■■■■□ 20
TARDBPQ13148 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.127e-7■■■■□ 20
TARDBPQ13148 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.57e-7■■■■□ 20
TARDBPQ13148 ZNF330-201ENST00000262990 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.698e-7■■■■□ 20
TARDBPQ13148 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.083e-10■■■■□ 20
TARDBPQ13148 ACAP2-212ENST00000481463 561 ntTSL 319.39■□□□□ 0.695e-16■■■■□ 20
TARDBPQ13148 ACAP2-211ENST00000480906 1802 ntTSL 1 (best)15.38■□□□□ 0.055e-16■■■■□ 20
TARDBPQ13148 RAD51B-205ENST00000471583 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.792e-6■■■■□ 20
TARDBPQ13148 RAD51B-208ENST00000479335 1615 ntTSL 1 (best)9.15□□□□□ -0.942e-6■■■■□ 20
TARDBPQ13148 RAD51B-212ENST00000488612 1550 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.182e-6■■■■□ 20
TARDBPQ13148 RAD51B-211ENST00000487861 1673 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.212e-6■■■■□ 20
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TARDBPQ13148 RAD51B-204ENST00000469165 1158 ntTSL 37.2□□□□□ -1.262e-6■■■■□ 20
TARDBPQ13148 RAD51B-203ENST00000468382 829 ntTSL 56.57□□□□□ -1.362e-6■■■■□ 20
TARDBPQ13148 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.42e-6■■■■□ 20
TARDBPQ13148 RAD51B-207ENST00000478014 618 ntTSL 36.3□□□□□ -1.42e-6■■■■□ 20
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TARDBPQ13148 RAD51B-219ENST00000554244 669 ntTSL 35.52□□□□□ -1.532e-6■■■■□ 20
TARDBPQ13148 RAD51B-214ENST00000497460 546 ntTSL 45.46□□□□□ -1.542e-6■■■■□ 20
TARDBPQ13148 RAD51B-216ENST00000553595 795 ntTSL 34.87□□□□□ -1.632e-6■■■■□ 20
TARDBPQ13148 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.292e-6■■■■□ 20
TARDBPQ13148 RNF217-210ENST00000521654 11325 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.542e-6■■■■□ 20
TARDBPQ13148 RNF217-207ENST00000519565 10660 ntTSL 54.19□□□□□ -1.742e-6■■■■□ 20
TARDBPQ13148 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.893e-6■■■■□ 20
TARDBPQ13148 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.53e-6■■■■□ 20
TARDBPQ13148 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.323e-6■■■■□ 20
TARDBPQ13148 DDI2-204ENST00000486680 1501 ntTSL 1 (best)15.33■□□□□ 0.056e-16■■■■□ 20
TARDBPQ13148 DDI2-202ENST00000480945 10625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.976e-16■■■■□ 20
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TARDBPQ13148 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.222e-7■■■■□ 19.9
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TARDBPQ13148 ZNF565-202ENST00000355114 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.79e-7■■■■□ 19.9
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TARDBPQ13148 SSX2IP-207ENST00000481102 2457 ntTSL 518.69■□□□□ 0.581e-7■■■■□ 19.9
TARDBPQ13148 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.431e-7■■■■□ 19.9
TARDBPQ13148 SSX2IP-201ENST00000342203 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.451e-7■■■■□ 19.9
TARDBPQ13148 SSX2IP-206ENST00000476905 2272 ntTSL 28.9□□□□□ -0.981e-7■■■■□ 19.9
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TARDBPQ13148 SMYD3-217ENST00000493441 823 ntTSL 28.47□□□□□ -1.053e-7■■■■□ 19.9
TARDBPQ13148 USP36-210ENST00000588086 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)13.81□□□□□ -0.22e-6■■■■□ 19.9
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TARDBPQ13148 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.476e-7■■■■□ 19.9
TARDBPQ13148 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.336e-7■■■■□ 19.9
TARDBPQ13148 FBXL20-201ENST00000264658 10388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.916e-7■■■■□ 19.9
TARDBPQ13148 SCMH1-207ENST00000372597 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.782e-7■■■■□ 19.9
TARDBPQ13148 SCMH1-206ENST00000372596 3323 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.882e-7■■■■□ 19.9
TARDBPQ13148 SCMH1-202ENST00000337495 3108 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.892e-7■■■■□ 19.9
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TARDBPQ13148 FAM49B-209ENST00000518879 820 ntTSL 518.88■□□□□ 0.612e-6■■■■□ 19.9
TARDBPQ13148 FAM49B-219ENST00000521223 587 ntTSL 418.79■□□□□ 0.62e-6■■■■□ 19.9
TARDBPQ13148 FAM49B-205ENST00000518167 421 ntTSL 518.58■□□□□ 0.562e-6■■■■□ 19.9
TARDBPQ13148 FAM49B-210ENST00000519020 573 ntTSL 516.07■□□□□ 0.162e-6■■■■□ 19.9
TARDBPQ13148 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.082e-6■■■■□ 19.9
TARDBPQ13148 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.072e-6■■■■□ 19.9
TARDBPQ13148 FAM49B-206ENST00000518283 574 ntTSL 48.97□□□□□ -0.972e-6■■■■□ 19.9
TARDBPQ13148 FAM49B-226ENST00000523509 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.292e-6■■■■□ 19.9
TARDBPQ13148 FAM49B-228ENST00000523993 581 ntTSL 36.05□□□□□ -1.442e-6■■■■□ 19.9
TARDBPQ13148 FAM49B-222ENST00000522702 544 ntTSL 44.63□□□□□ -1.672e-6■■■■□ 19.9
TARDBPQ13148 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.762e-6■■■■□ 19.9
TARDBPQ13148 FAM49B-225ENST00000523288 4552 ntTSL 24.02□□□□□ -1.772e-6■■■■□ 19.9
TARDBPQ13148 KANSL3-202ENST00000416138 552 ntTSL 418.91■□□□□ 0.621e-9■■■■□ 19.8
TARDBPQ13148 KANSL3-211ENST00000452268 1448 ntTSL 516.95■□□□□ 0.31e-9■■■■□ 19.8
TARDBPQ13148 KANSL3-210ENST00000451819 693 ntTSL 514.47□□□□□ -0.091e-9■■■■□ 19.8
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