Protein–RNA interactions for Protein: Q13107

USP4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4Q13107 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
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USP4Q13107 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP4Q13107 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP4Q13107 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP4Q13107 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP4Q13107 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
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USP4Q13107 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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USP4Q13107 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
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USP4Q13107 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
USP4Q13107 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
USP4Q13107 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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USP4Q13107 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
USP4Q13107 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
USP4Q13107 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
USP4Q13107 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
USP4Q13107 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
USP4Q13107 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
USP4Q13107 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
USP4Q13107 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
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USP4Q13107 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
USP4Q13107 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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USP4Q13107 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
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USP4Q13107 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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USP4Q13107 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP4Q13107 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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USP4Q13107 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP4Q13107 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP4Q13107 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP4Q13107 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP4Q13107 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP4Q13107 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP4Q13107 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP4Q13107 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP4Q13107 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP4Q13107 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP4Q13107 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP4Q13107 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP4Q13107 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP4Q13107 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP4Q13107 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
USP4Q13107 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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