Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
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