Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TGM3Q08188 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms