Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
SOX4Q06945 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SOX4Q06945 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms