Protein–RNA interactions for Protein: Q06418

TYRO3, Tyrosine-protein kinase receptor TYRO3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYRO3Q06418 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TYRO3Q06418 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TYRO3Q06418 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TYRO3Q06418 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TYRO3Q06418 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TYRO3Q06418 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TYRO3Q06418 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TYRO3Q06418 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TYRO3Q06418 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TYRO3Q06418 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TYRO3Q06418 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TYRO3Q06418 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TYRO3Q06418 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TYRO3Q06418 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TYRO3Q06418 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TYRO3Q06418 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TYRO3Q06418 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TYRO3Q06418 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TYRO3Q06418 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TYRO3Q06418 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TYRO3Q06418 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TYRO3Q06418 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TYRO3Q06418 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TYRO3Q06418 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TYRO3Q06418 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TYRO3Q06418 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TYRO3Q06418 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TYRO3Q06418 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TYRO3Q06418 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TYRO3Q06418 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TYRO3Q06418 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TYRO3Q06418 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TYRO3Q06418 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TYRO3Q06418 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TYRO3Q06418 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TYRO3Q06418 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TYRO3Q06418 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TYRO3Q06418 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TYRO3Q06418 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TYRO3Q06418 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TYRO3Q06418 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TYRO3Q06418 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TYRO3Q06418 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TYRO3Q06418 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TYRO3Q06418 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TYRO3Q06418 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TYRO3Q06418 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TYRO3Q06418 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TYRO3Q06418 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TYRO3Q06418 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TYRO3Q06418 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TYRO3Q06418 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TYRO3Q06418 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TYRO3Q06418 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TYRO3Q06418 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TYRO3Q06418 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TYRO3Q06418 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TYRO3Q06418 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TYRO3Q06418 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TYRO3Q06418 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TYRO3Q06418 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TYRO3Q06418 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TYRO3Q06418 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TYRO3Q06418 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TYRO3Q06418 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TYRO3Q06418 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TYRO3Q06418 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TYRO3Q06418 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TYRO3Q06418 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TYRO3Q06418 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TYRO3Q06418 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TYRO3Q06418 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TYRO3Q06418 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TYRO3Q06418 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TYRO3Q06418 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TYRO3Q06418 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TYRO3Q06418 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TYRO3Q06418 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TYRO3Q06418 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TYRO3Q06418 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TYRO3Q06418 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TYRO3Q06418 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TYRO3Q06418 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TYRO3Q06418 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TYRO3Q06418 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TYRO3Q06418 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TYRO3Q06418 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TYRO3Q06418 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TYRO3Q06418 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TYRO3Q06418 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TYRO3Q06418 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TYRO3Q06418 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TYRO3Q06418 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TYRO3Q06418 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TYRO3Q06418 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TYRO3Q06418 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TYRO3Q06418 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TYRO3Q06418 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TYRO3Q06418 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TYRO3Q06418 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms