Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKCDQ05655 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms