Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NUCB2P80303 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NUCB2P80303 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms