Protein–RNA interactions for Protein: P61587

RND3, Rho-related GTP-binding protein RhoE, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND3P61587 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RND3P61587 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RND3P61587 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RND3P61587 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RND3P61587 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RND3P61587 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RND3P61587 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RND3P61587 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RND3P61587 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RND3P61587 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RND3P61587 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RND3P61587 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RND3P61587 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RND3P61587 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RND3P61587 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RND3P61587 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RND3P61587 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RND3P61587 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RND3P61587 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RND3P61587 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RND3P61587 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RND3P61587 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RND3P61587 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RND3P61587 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RND3P61587 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RND3P61587 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RND3P61587 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RND3P61587 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RND3P61587 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RND3P61587 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RND3P61587 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RND3P61587 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RND3P61587 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RND3P61587 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RND3P61587 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RND3P61587 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RND3P61587 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RND3P61587 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RND3P61587 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RND3P61587 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RND3P61587 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RND3P61587 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RND3P61587 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RND3P61587 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RND3P61587 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RND3P61587 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RND3P61587 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RND3P61587 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RND3P61587 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RND3P61587 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RND3P61587 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RND3P61587 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RND3P61587 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RND3P61587 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RND3P61587 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RND3P61587 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RND3P61587 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RND3P61587 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RND3P61587 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RND3P61587 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RND3P61587 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RND3P61587 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RND3P61587 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RND3P61587 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RND3P61587 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RND3P61587 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RND3P61587 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RND3P61587 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RND3P61587 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RND3P61587 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RND3P61587 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RND3P61587 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RND3P61587 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RND3P61587 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RND3P61587 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RND3P61587 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RND3P61587 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RND3P61587 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RND3P61587 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RND3P61587 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RND3P61587 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RND3P61587 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RND3P61587 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RND3P61587 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RND3P61587 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RND3P61587 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RND3P61587 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RND3P61587 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RND3P61587 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RND3P61587 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RND3P61587 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RND3P61587 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RND3P61587 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RND3P61587 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RND3P61587 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RND3P61587 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RND3P61587 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RND3P61587 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RND3P61587 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RND3P61587 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms