Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN8P56748 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms