Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAG2P55895 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAG2P55895 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAG2P55895 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAG2P55895 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAG2P55895 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAG2P55895 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAG2P55895 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAG2P55895 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAG2P55895 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAG2P55895 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAG2P55895 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAG2P55895 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAG2P55895 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAG2P55895 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAG2P55895 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAG2P55895 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAG2P55895 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAG2P55895 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAG2P55895 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAG2P55895 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAG2P55895 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAG2P55895 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAG2P55895 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAG2P55895 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAG2P55895 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAG2P55895 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAG2P55895 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAG2P55895 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAG2P55895 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAG2P55895 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAG2P55895 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAG2P55895 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAG2P55895 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAG2P55895 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAG2P55895 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAG2P55895 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAG2P55895 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAG2P55895 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAG2P55895 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RAG2P55895 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAG2P55895 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAG2P55895 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAG2P55895 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAG2P55895 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAG2P55895 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAG2P55895 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAG2P55895 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAG2P55895 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAG2P55895 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAG2P55895 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAG2P55895 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAG2P55895 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAG2P55895 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAG2P55895 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAG2P55895 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAG2P55895 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RAG2P55895 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAG2P55895 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAG2P55895 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAG2P55895 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAG2P55895 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAG2P55895 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAG2P55895 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAG2P55895 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAG2P55895 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAG2P55895 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAG2P55895 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAG2P55895 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAG2P55895 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAG2P55895 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAG2P55895 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAG2P55895 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAG2P55895 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAG2P55895 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAG2P55895 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAG2P55895 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAG2P55895 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAG2P55895 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAG2P55895 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAG2P55895 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAG2P55895 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAG2P55895 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAG2P55895 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAG2P55895 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAG2P55895 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAG2P55895 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAG2P55895 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAG2P55895 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAG2P55895 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAG2P55895 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAG2P55895 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAG2P55895 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAG2P55895 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAG2P55895 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAG2P55895 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAG2P55895 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAG2P55895 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAG2P55895 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAG2P55895 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms