Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP9P55211 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP9P55211 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP9P55211 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP9P55211 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP9P55211 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP9P55211 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP9P55211 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP9P55211 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP9P55211 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP9P55211 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP9P55211 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP9P55211 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP9P55211 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP9P55211 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP9P55211 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP9P55211 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP9P55211 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP9P55211 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP9P55211 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP9P55211 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP9P55211 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CASP9P55211 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP9P55211 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP9P55211 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP9P55211 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP9P55211 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP9P55211 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP9P55211 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP9P55211 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP9P55211 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP9P55211 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP9P55211 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP9P55211 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP9P55211 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP9P55211 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP9P55211 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP9P55211 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP9P55211 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP9P55211 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP9P55211 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP9P55211 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP9P55211 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP9P55211 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP9P55211 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP9P55211 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP9P55211 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP9P55211 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP9P55211 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP9P55211 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP9P55211 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP9P55211 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP9P55211 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP9P55211 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP9P55211 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP9P55211 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP9P55211 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP9P55211 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP9P55211 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP9P55211 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP9P55211 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP9P55211 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP9P55211 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP9P55211 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASP9P55211 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP9P55211 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP9P55211 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP9P55211 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP9P55211 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP9P55211 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP9P55211 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP9P55211 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP9P55211 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP9P55211 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP9P55211 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP9P55211 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP9P55211 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP9P55211 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP9P55211 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP9P55211 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP9P55211 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP9P55211 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP9P55211 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP9P55211 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP9P55211 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP9P55211 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP9P55211 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP9P55211 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP9P55211 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP9P55211 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP9P55211 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP9P55211 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP9P55211 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP9P55211 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP9P55211 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP9P55211 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP9P55211 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP9P55211 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP9P55211 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP9P55211 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms