Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms