Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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