Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFSF9P41273 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms