Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GGCXP38435 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GGCXP38435 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GGCXP38435 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GGCXP38435 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GGCXP38435 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GGCXP38435 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GGCXP38435 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GGCXP38435 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GGCXP38435 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GGCXP38435 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GGCXP38435 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GGCXP38435 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GGCXP38435 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GGCXP38435 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GGCXP38435 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GGCXP38435 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GGCXP38435 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GGCXP38435 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GGCXP38435 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GGCXP38435 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GGCXP38435 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GGCXP38435 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GGCXP38435 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GGCXP38435 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GGCXP38435 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GGCXP38435 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GGCXP38435 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GGCXP38435 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GGCXP38435 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GGCXP38435 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GGCXP38435 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GGCXP38435 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GGCXP38435 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GGCXP38435 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GGCXP38435 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GGCXP38435 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GGCXP38435 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GGCXP38435 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GGCXP38435 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GGCXP38435 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GGCXP38435 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GGCXP38435 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GGCXP38435 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GGCXP38435 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GGCXP38435 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GGCXP38435 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GGCXP38435 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GGCXP38435 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GGCXP38435 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GGCXP38435 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GGCXP38435 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GGCXP38435 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GGCXP38435 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GGCXP38435 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GGCXP38435 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GGCXP38435 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GGCXP38435 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GGCXP38435 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GGCXP38435 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GGCXP38435 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GGCXP38435 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GGCXP38435 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GGCXP38435 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GGCXP38435 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GGCXP38435 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GGCXP38435 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GGCXP38435 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GGCXP38435 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GGCXP38435 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GGCXP38435 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GGCXP38435 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GGCXP38435 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GGCXP38435 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GGCXP38435 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GGCXP38435 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GGCXP38435 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GGCXP38435 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GGCXP38435 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GGCXP38435 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GGCXP38435 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GGCXP38435 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GGCXP38435 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GGCXP38435 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GGCXP38435 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GGCXP38435 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GGCXP38435 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GGCXP38435 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GGCXP38435 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GGCXP38435 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GGCXP38435 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GGCXP38435 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GGCXP38435 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GGCXP38435 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GGCXP38435 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GGCXP38435 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GGCXP38435 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GGCXP38435 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GGCXP38435 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GGCXP38435 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms