Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms