Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCAP28676 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCAP28676 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCAP28676 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCAP28676 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCAP28676 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCAP28676 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCAP28676 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCAP28676 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCAP28676 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCAP28676 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCAP28676 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCAP28676 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCAP28676 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCAP28676 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCAP28676 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCAP28676 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCAP28676 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCAP28676 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCAP28676 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCAP28676 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCAP28676 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GCAP28676 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCAP28676 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GCAP28676 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GCAP28676 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCAP28676 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCAP28676 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCAP28676 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCAP28676 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCAP28676 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCAP28676 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCAP28676 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCAP28676 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCAP28676 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCAP28676 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCAP28676 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCAP28676 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCAP28676 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCAP28676 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCAP28676 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCAP28676 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCAP28676 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCAP28676 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCAP28676 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCAP28676 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCAP28676 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCAP28676 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GCAP28676 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCAP28676 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCAP28676 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCAP28676 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GCAP28676 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCAP28676 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCAP28676 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GCAP28676 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCAP28676 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCAP28676 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCAP28676 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCAP28676 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCAP28676 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCAP28676 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCAP28676 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCAP28676 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCAP28676 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCAP28676 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCAP28676 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCAP28676 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCAP28676 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCAP28676 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCAP28676 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCAP28676 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCAP28676 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCAP28676 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCAP28676 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCAP28676 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCAP28676 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GCAP28676 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCAP28676 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCAP28676 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCAP28676 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCAP28676 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCAP28676 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCAP28676 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCAP28676 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCAP28676 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCAP28676 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCAP28676 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCAP28676 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCAP28676 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCAP28676 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCAP28676 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCAP28676 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCAP28676 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCAP28676 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCAP28676 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCAP28676 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCAP28676 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCAP28676 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCAP28676 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms