Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALB2P22676 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALB2P22676 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALB2P22676 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALB2P22676 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALB2P22676 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALB2P22676 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALB2P22676 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALB2P22676 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALB2P22676 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALB2P22676 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CALB2P22676 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALB2P22676 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALB2P22676 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALB2P22676 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALB2P22676 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALB2P22676 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CALB2P22676 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALB2P22676 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALB2P22676 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALB2P22676 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALB2P22676 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALB2P22676 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALB2P22676 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALB2P22676 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALB2P22676 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALB2P22676 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALB2P22676 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALB2P22676 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALB2P22676 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALB2P22676 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALB2P22676 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALB2P22676 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALB2P22676 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALB2P22676 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALB2P22676 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALB2P22676 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALB2P22676 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALB2P22676 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALB2P22676 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALB2P22676 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALB2P22676 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALB2P22676 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALB2P22676 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALB2P22676 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALB2P22676 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALB2P22676 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALB2P22676 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALB2P22676 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALB2P22676 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CALB2P22676 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALB2P22676 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALB2P22676 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALB2P22676 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALB2P22676 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALB2P22676 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALB2P22676 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALB2P22676 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALB2P22676 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALB2P22676 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALB2P22676 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALB2P22676 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALB2P22676 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALB2P22676 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALB2P22676 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALB2P22676 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALB2P22676 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALB2P22676 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALB2P22676 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALB2P22676 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALB2P22676 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALB2P22676 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALB2P22676 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALB2P22676 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALB2P22676 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALB2P22676 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALB2P22676 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CALB2P22676 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CALB2P22676 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CALB2P22676 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CALB2P22676 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CALB2P22676 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CALB2P22676 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALB2P22676 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALB2P22676 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALB2P22676 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALB2P22676 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALB2P22676 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALB2P22676 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CALB2P22676 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CALB2P22676 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALB2P22676 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALB2P22676 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALB2P22676 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALB2P22676 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALB2P22676 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CALB2P22676 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALB2P22676 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALB2P22676 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALB2P22676 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms