Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT1P21579 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT1P21579 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT1P21579 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT1P21579 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT1P21579 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT1P21579 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT1P21579 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT1P21579 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT1P21579 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT1P21579 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT1P21579 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT1P21579 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SYT1P21579 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SYT1P21579 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SYT1P21579 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT1P21579 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT1P21579 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT1P21579 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT1P21579 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT1P21579 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT1P21579 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT1P21579 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT1P21579 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT1P21579 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT1P21579 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT1P21579 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT1P21579 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT1P21579 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT1P21579 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT1P21579 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT1P21579 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT1P21579 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT1P21579 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT1P21579 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT1P21579 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT1P21579 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT1P21579 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT1P21579 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT1P21579 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT1P21579 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT1P21579 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT1P21579 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT1P21579 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT1P21579 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYT1P21579 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYT1P21579 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYT1P21579 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYT1P21579 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYT1P21579 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYT1P21579 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYT1P21579 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYT1P21579 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SYT1P21579 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SYT1P21579 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYT1P21579 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYT1P21579 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYT1P21579 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYT1P21579 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SYT1P21579 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SYT1P21579 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SYT1P21579 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SYT1P21579 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYT1P21579 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYT1P21579 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SYT1P21579 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SYT1P21579 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SYT1P21579 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SYT1P21579 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYT1P21579 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SYT1P21579 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYT1P21579 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT1P21579 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT1P21579 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT1P21579 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT1P21579 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT1P21579 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT1P21579 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT1P21579 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT1P21579 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT1P21579 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT1P21579 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT1P21579 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT1P21579 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT1P21579 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT1P21579 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT1P21579 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT1P21579 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT1P21579 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT1P21579 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT1P21579 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT1P21579 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT1P21579 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT1P21579 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT1P21579 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT1P21579 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT1P21579 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT1P21579 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT1P21579 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT1P21579 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms