Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2CP19387 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms